未分類test import mrcfile import numpy as np def read_pdb_coords(pdb_file): coords = [] with open(pdb_file, 'r') as f: ... 2023.09.20未分類
未分類rdkitで特定の原子に構造を付加するスクリプト from rdkit import Chem from rdkit.Chem import AllChem # PDBファイルから分子を読み込む mol = Chem.MolFromPDBFile('path_to_your_pdb_f... 2023.08.17未分類
未分類平和不動産について調べてみた 平和不動産について調べてみた 日本が金融ハブになった時に間違いなくアガある株である平和不動産について調べてみた。 日本が金融ハブになることはすでに確定している可能性が高いと思います。なぜそう思っているのか?新冷戦がスタートした2013... 2023.07.22未分類
未分類2023年7月投資の雑観 7月 ここから簡単に戻すようなチャートには見えないですが、戻すんですかね? 為替も介入がちらつかせるようになってきたので、色々と、そろそろ逆方向に動き出しそうな気がする。 Fear & Greed 指数 米国も過熱感... 2023.07.09未分類
未分類2023年6月投資の考え 6月3日騰落レシオ ちょっと過熱感は落ち着いてきているが、日経平均は鰻登り。 日経平均寄与率大銘柄とその他銘柄とで過熱感に大きな乖離がある。 一般個人投資家は冷めている様子。 メガ不動産が動き出している感じあり 注目株 ... 2023.06.03未分類
未分類愛知電機 2023.4Qの営業利益の落ち込みはひどい 円安は追い風 時価総額315億円(2023/05/29) 投資に気合が入っている 投資キャッシュフローがでかい。 2017年度決算では、電力機器のセグメント利益が大きい一... 2023.05.30未分類
未分類chatGPTに入力できるtoken数と日本語が英語に比べて不利である理由 アプリンゴ chatGPTなどに入力する際に日本語と英語では入力できる内容量が異なってくると思います。 chatGPTに入力できるトークン量は約4000だと思いますがあってますか? また、日本語の場合は助詞の”てにをは”が入っ... 2023.05.20未分類
未分類In silico evolution of protein binders with deep learning models for structure prediction and sequence design タンパク質-タンパク質相互作用を設計するための計算方法の開発においてかなりの進歩がありましたが、大規模なスクリーニングや成熟を経ずに高親和性バインダーを開発することは依然として困難です。ここでは、深層学習(DL)に基づく構造予測(Alpha... 2023.05.14未分類
未分類Torsional Diffusion for Molecular Conformer Generation 論文のリンク 要旨 分子コンフォーマー生成は、計算化学における基本的なタスクです。いくつかの機械学習アプローチが開発されていますが、いずれも最先端の化学情報学の方法を上回ることはありません。我々は、トーション角空間で操作する新たな... 2023.05.14未分類
RDkitRDkitのGetSSSRについて smallest set of simple rings(SSSR) GetSSR (Get Smallest Set of Smallest Rings) は、分子に対して最小の単純な環の集合を取得する関数です。RDKit の rdki... 2023.05.07RDkit