未分類Nanodropを使ってDNAとタンパク質の濃度を正確に測る方法 Nanodropを使うと簡単に濃度が測れるけどどうなってるの? NanodropはキュベットいらずでDNA濃度・タンパク質濃度を測れるので便利なのですが、何をどう測っているのかを理解しておくことは超重要です。 特に従来の分光計で使われる... 2022.09.10未分類
未分類pyenv をアップデートして最新のpythonを使えるようにする pyenv 自体のバージョンが古いと新しいpythonをインストールできない。ということに最近気付いた(気付いていなかった。pyenvだと3.8系までしかインストールできないんだと変に思い込んでいた)。 git clone $(pyen... 2022.09.04未分類
未分類Kickstarter Projects のデータで機械学習の手法を総まとめ Kickstarter Projects のデータで機械学習の手法を色々試してみる 混同行列まとめ Accuracy 全てのデータの中でどれくらい正解しているか $$\frac{TP+TN}{TP+TN+FP+FN}$$ Pr... 2022.08.11未分類
未分類python・numpy 3次元配列へのパディング(numpy.pad) shapeが(10, 9, 14)のような3次元配列(volume)を周りをゼロで埋めて立方体にしたい場合 numpy.padが便利です。 numpy.pad(array, pad_width, mode='constant', **k... 2022.07.02未分類
クラウドDeta.shを使ってみた Detaとは Deta Cloudは、ドイツ・ベルリンに本拠を構えるAbstract Computingが運営する無料のクラウドサービスです。 "アイデアとクラウドアプリケーションの間のギャップを劇的に減少させる" のが目標らしいで... 2022.05.01クラウド未分類
未分類Ubuntuにanacondaをインストールして利用するときに気に留めておく重要ポイント インストール時に聞かれるconda initって何? Do you wish the installer to initialize Anaconda3 by running conda init? yesにすると、 # >&... 2022.04.09未分類
未分類トヨタ自動車株が時価総額をうわまわる資産バリュー株:ATグループ トヨタ自動車さまさまの愛知のディーラーATグループ トヨタ自動車株を5,842,290株保有(2021/03有価証券報告書より)している。 トヨタ自動車株の5分割後、29,211,450株 x 2105.5 = 615億円 ATグルー... 2022.01.04未分類
未分類Python PandasでATR(Average True Range)を計算する方法 ATR(Average True Range)とは何か? 文章で説明してもなかなかわかりづらいので、実際に計算するプログラムで確認していきましょう。 案外プログラムで実際に見てみると理解しやすかったりします。 プログラミングからみるA... 2021.10.09未分類
未分類ソフトマックス関数とオーバーフロー ソフトマックス関数 オーバーフローは計算上の問題で、例えば、exp(1000)とかって桁が大きすぎて計算できないのです。 numpyだと、710でinfという無限大を表す数になってしまいます。計算不能ですね。 >&g... 2021.10.03未分類
未分類具体例で丁寧にタンパク質のモル濃度の計算方法を解説していく 最初にまとめ 1 mg/mlをサクッと求めるためには1/ Mを計算すれば良い 分子量100000(100kDa)のタンパク質の場合、 1 mg/ml は 1/100000 M = 10-5 M = 10-2 mM = 10μM 詳... 2021.09.23未分類