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Nanodropを使ってDNAとタンパク質の濃度を正確に測る方法

Nanodropを使うと簡単に濃度が測れるけどどうなってるの? NanodropはキュベットいらずでDNA濃度・タンパク質濃度を測れるので便利なのですが、何をどう測っているのかを理解しておくことは超重要です。 特に従来の分光計で使われる...
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pyenv をアップデートして最新のpythonを使えるようにする

pyenv 自体のバージョンが古いと新しいpythonをインストールできない。ということに最近気付いた(気付いていなかった。pyenvだと3.8系までしかインストールできないんだと変に思い込んでいた)。 git clone $(pyen...
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Kickstarter Projects のデータで機械学習の手法を総まとめ

Kickstarter Projects のデータで機械学習の手法を色々試してみる 混同行列まとめ Accuracy 全てのデータの中でどれくらい正解しているか $$\frac{TP+TN}{TP+TN+FP+FN}$$ Pr...
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python・numpy 3次元配列へのパディング(numpy.pad)

shapeが(10, 9, 14)のような3次元配列(volume)を周りをゼロで埋めて立方体にしたい場合 numpy.padが便利です。 numpy.pad(array, pad_width, mode='constant', **k...
クラウド

Deta.shを使ってみた

Detaとは Deta Cloudは、ドイツ・ベルリンに本拠を構えるAbstract Computingが運営する無料のクラウドサービスです。 "アイデアとクラウドアプリケーションの間のギャップを劇的に減少させる"  のが目標らしいで...
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Ubuntuにanacondaをインストールして利用するときに気に留めておく重要ポイント

インストール時に聞かれるconda initって何? Do you wish the installer to initialize Anaconda3 by running conda init? yesにすると、 # >&...
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トヨタ自動車株が時価総額をうわまわる資産バリュー株:ATグループ

トヨタ自動車さまさまの愛知のディーラーATグループ トヨタ自動車株を5,842,290株保有(2021/03有価証券報告書より)している。 トヨタ自動車株の5分割後、29,211,450株 x 2105.5 = 615億円 ATグルー...
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Python PandasでATR(Average True Range)を計算する方法

ATR(Average True Range)とは何か? 文章で説明してもなかなかわかりづらいので、実際に計算するプログラムで確認していきましょう。 案外プログラムで実際に見てみると理解しやすかったりします。 プログラミングからみるA...
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ソフトマックス関数とオーバーフロー

ソフトマックス関数 オーバーフローは計算上の問題で、例えば、exp(1000)とかって桁が大きすぎて計算できないのです。 numpyだと、710でinfという無限大を表す数になってしまいます。計算不能ですね。 >&g...
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具体例で丁寧にタンパク質のモル濃度の計算方法を解説していく

最初にまとめ 1 mg/mlをサクッと求めるためには1/ Mを計算すれば良い 分子量100000(100kDa)のタンパク質の場合、 1 mg/ml は 1/100000 M = 10-5 M = 10-2 mM = 10μM 詳...