水を介したタンパク質間相互作用で一番すごいのはこの相互作用だと思う

Crystal Structural Analysis of Barnase-barstar Complex  (PDB: 2ZA4)

AF2は共変する残基を予測し、構造を記憶によって埋めます。これにより、非常に強いヘテロ二量体の典型的な例であるbarnase+barnstarをモデル化する際、AF2は適切な構造を予測できます。おそらく、EvoFold（共変性は使用しますが、アテンション変換は使用しません）では難しいでしょう。また、Amber最小化は暗黙の溶媒で行われるため、Amberが構造を少し悪化させる可能性があります。

小さなタンパク質であるユビキチンは、その表面にLYS+HOH+ASPを持っており、予測することが難しい例です。