アプリンゴ

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愛知電機

2023.4Qの営業利益の落ち込みはひどい円安は追い風時価総額315億円(2023/05/29)投資に気合が入っている投資キャッシュフローがでかい。2017年度決算では、電力機器のセグメント利益が大きい一方で、2023年には回転機セグメント...
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chatGPTに入力できるtoken数と日本語が英語に比べて不利である理由

アプリンゴchatGPTなどに入力する際に日本語と英語では入力できる内容量が異なってくると思います。 chatGPTに入力できるトークン量は約4000だと思いますがあってますか? また、日本語の場合は助詞の”てにをは”が入ってくるため、トー...
RDkit

RDkitのGetSSSRについて

smallest set of simple rings(SSSR)GetSSR (Get Smallest Set of Smallest Rings) は、分子に対して最小の単純な環の集合を取得する関数です。RDKit の rdkit....
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オープンソース大規模言語モデルがGoogleやOpenAIをやっつける?

Metaが公開したLLaMAを中心としたコミュニティでの活動が強すぎて、オープンソース大規模言語モデルの性能上昇が凄い!OpenAIが追いつかれるのも時間の問題 だろうという。GAFAMに支配されるという世界線は遠のいているかもという記事。...
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水を介したタンパク質間相互作用で一番すごいのはこの相互作用だと思う

Crystal Structural Analysis of Barnase-barstar Complex  (PDB: 2ZA4)AF2は共変する残基を予測し、構造を記憶によって埋めます。これにより、非常に強いヘテロ二量体の典型的な例で...
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SE(3)不変性の重要性とは

SE(3)不変性(特殊ユークリッド群の不変性)は、機械学習モデルにおいて、3次元空間の回転および並進変換に対して不変であることを意味します。つまり、SE(3)不変性を持つモデルは、分子の3次元構造が回転や並進によってどのように変換されても、...
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Sequence recovery rate(配列回復率)とは

タンパク質バックボーンから配列を生成する際のSequence recovery rate(配列回復率)は、生成された配列が元のターゲット配列とどれだけ一致しているかを示す指標です。これは、予測された配列と実際の配列の間で、どれだけ正確にアミ...
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Pythonでmrcfileパッケージを使って、mrcファイルからoriginとpixelsizeを抽出し、PDBファイルの座標にangstrom単位で適用する方法

Pythonでmrcfileパッケージを使って、mrcファイルからoriginとpixelsizeを抽出し、PDBファイルの座標にangstrom単位で適用する方法について説明します。 まず、必要なパッケージをインストールします。ターミナル...
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国際特許制度について

アプリンゴ国際特許が出ていたとして、日本で特許が成立していなければ、その特許を利用しても良いのでしょうか? その後日本で特許が成立した場合、過去に遡って特許利用が問題になるでしょうか?赤リンゴ国際特許というものは厳密には存在しません。PCT...
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MRCファイルの操作方法いろいろ

mrcfileと言うモジュールを使ってmrcファイルからheaderに書かれているorigin情報を抜き出し、origin_info.txtとして保存し、その後headerのoriginを0にセットしてファイルを保存する方法pip inst...