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mrcfileと言うモジュールを使ってmrcファイルからheaderに書かれているorigin情報を抜き出し、origin_info.txtとして保存し、その後headerのoriginを0にセットしてファイルを保存する方法 pip ins...

モジュールをpip install しないでPDBファイルの座標x,y,z を任意の一定量シフトするプログラム def shift_pdb_coordinates(pdb_file, x_shift, y_shift, z_shift): ...

Hydraは、複雑なアプリケーション設定を管理するためのフレームワークです。以下に、Hydraが便利な理由を示す具体例をいくつか紹介します。 階層的な設定管理: Hydraは、YAMLファイルを使って階層的な設定管理を行うことができます。こ...

コードの簡素化・chatGPTによる添削 プログラミングでは、瞬時に最適なコードが書けるわけではありません。 最適化された簡潔なコードを書くためには、何度も書き直す必要があります。 ChatGPTを使うことで、書き直しの回数を減らすことがで...

ふるさと納税 年収が１２００万円程度なので、我が家では児童手当がもらえません。 というわけでふるさと納税で補填するスタイルです。サラリーマンは辛いですな。 帰省費用 関西に自宅があればJTBのクーポンがもらえるこれがおすすめ。 【京都市】で...

MathJaxは超便利な数式ツールなのですが、Wordpressで使う場合若干の注意が必要です。 そんな情報をまとめておきます。 数式を記述した後、その後に改行が必要。改行がない場合、適切に表示されない。 を表示したくて、 <p>$$\be...

内積が０である２つのベクトルは直交している（ベクトルの向きが90度異なる） \( \boldsymbol{a} \cdot \boldsymbol{b} \) = 0 ノルム　２乗和のルートをとったもの \( a = \| \boldsym...

Nanodropを使うと簡単に濃度が測れるけどどうなってるの？ NanodropはキュベットいらずでDNA濃度・タンパク質濃度を測れるので便利なのですが、何をどう測っているのかを理解しておくことは超重要です。 特に従来の分光計で使われるキュ...

pyenv 自体のバージョンが古いと新しいpythonをインストールできない。ということに最近気付いた（気付いていなかった。pyenvだと3.8系までしかインストールできないんだと変に思い込んでいた）。 git clone $(pyenv ...

Kickstarter Projects のデータで機械学習の手法を色々試してみる 混同行列まとめ Accuracy 全てのデータの中でどれくらい正解しているか $$\frac{TP+TN}{TP+TN+FP+FN}$$ Precision...